现在于孝天保证他们只要
出兵权，就既往不咎，而且还会给他们以厚抚，让他们回家荣养，当一个富家翁，已经算是特别开恩了。如果他们不抓住这个机会的话，恐怕等于孝天回头解决了建奴之后，就不会再给他们开出这么优厚的条件，到时候他们恐怕除了要
出兵权之外，连一个好下场都很难得到。祖大寿迫于形势，最终也只能服软，接受了于孝天给他开出的条件，至于于孝天邀请他入兵部做事，他也选择了婉拒，因为他作为一个外系之人，今后兵部肯定都是于孝天直系的手下，他即便是入兵部，估计也会受到排挤，绝难掌握多少权力，倒不如干脆现在就急
勇退，回家当个富家翁，不问世事的好。现在他已经可以确定，大明已经不是以前的大明了，眼前的这个于孝天，才是以后真正的主宰者，他是绝不容有任何军将，在他的眼皮下面拥兵自重的，与其与他对抗，倒还不如老老实实听命于他，可以落得一个好的结局。
于孝天说服了祖大寿之后，也松了一口气，对于关宁军，一直以来都是他的一块心病，甚至于此次率兵出关之前，他已经做好了最坏的打算，如果祖大寿等关宁诸将不肯听命于他，
出兵权重编关宁军的话，他甚至已经做好了准备，在收拾建奴之前，先把这帮关宁军将给收拾掉，以解后顾之忧。但是现在看来，他不用再担心这个事情了，祖大寿是个很聪明的人，而且知道事情该怎么做，还没有自大到认为凭借他们关宁军之力，可以和他于孝天对抗的程度，这次较为爽快的答应了他的条件，那么这对于以后他经略辽东，便是一个好事。
起码免去了一场不必要的杀戮，可以让关外少死不少人，这对于以后恢复辽东的生产，也可以起到不小的作用，在这方面祖大寿这么做，可以说是有功于社稷，有功于民族，于是于孝天起身对祖大寿深施一礼道：“于某多谢祖大帅如此开明，于某代整个辽东百姓，谢过祖大帅！
但是此事还不急于一时，一切可以等到我等联手讨灭建奴之后再说！此次于某亲征辽东，还望祖大帅能不吝配合于某，一雪我大明数十年之辱！
如果这一次关宁军能建立功勋，那么于某此后可以重新考虑对于部分有功之人的安排！…”
祖大寿回到锦州城之中以后，立即将跟着他混的那些关宁诸将召集到了一起，将此次他和于孝天谈判的结果告知了众人。
众人一听顿时一片哗然，不同意的人大有人在，许多人当场就蹦了起来，咋呼着决不答应，甚至于有人当即就要回去点兵带兵自立山头去。
但是这些人的嚣闹很快被祖大寿一声怒喝给压制了下去，祖大寿冷眼扫了在场之人一遍，冷森森的对他们呵斥了一番，对他们陈明利害，把该说的又对他们说了一遍。
并且告诉这帮人，他已经同意了于孝天的提议，决定在此次于孝天讨灭建奴之后，便第一个
出兵权，如果谁要是不肯就范，非要带兵去自立山头的话，他第一个不答应，谁这么做就是跟他为敌，就算是于孝天暂时不去理他们，他祖大寿也会率兵对其进行进剿。听了祖大寿这么一说，这帮家伙顿时都蔫儿了下来，心知事情恐怕已经是无法挽回，如果祖大寿不肯带着他们闹事的话，那么仅凭着他们这些人自己下去胡闹，估计完全没有半丝胜算，这样蹦出去跟于孝天作对，其实就是自己找死，而且估计于孝天也很乐意有人这么跳出来，当出头鸟！
现如今要是有人主动跳出去充当这个出头鸟的话，无疑将是于孝天最希望看到的，他肯定会用雷霆手段将这些个出头鸟给全部干掉，这一点在场的这些关宁军将们都不是傻子，肯定是没人愿意充当这个出头鸟的，既然没有人敢跳出去，那么他们也就出了接受之外，再没有任何办法了。
祖大寿这才算是彻底把这帮关宁诸将给按了下去，接下来又告诉他们，事情还有转机，于孝天有言在先，如果这次他率军对建奴进剿之中，他们这些关宁诸将愿意全力配合，并且立下战功的话，那么事后可以重新考虑对他们的任用问题，但是如果有人想要趁着这个机会给他添乱的话，于孝天丑话也说到了前面，诛其九族绝无二话，必将他们举家上下满门连
拔起，绝不心慈手软。如此一手打一手拉的情况下，这些关宁诸将就算是不情不愿，也只能接受眼下的这个事实，纷纷偃旗息鼓，表示愿意听祖大寿的吩咐，按照祖大寿的吩咐行事。
崇祯十五年八月初七，一场大明和建奴之间的最后对决终于在辽东上演了，于孝天率领三万余于家军主力，从锦州出发，直扑大凌河。
一支早已在渤海湾之中待命的北方舰队的船队，随即派出众多小型船只，直入大凌河口，协助于家军主力强渡过了大凌河，直扑大凌河堡，也挑起了第二次大凌河堡之战。
只是这一次攻守双方却
还了位置，建奴军成了守方，明军也就是于家军却成了攻方。大凌河堡现如今也乃是建奴在辽东防御关内明军的第一道防线，所以这几年来，被建奴大力经营，不断的扩建加固，使得大凌河堡已经形成了完善的防御体系。
而且皇太极把最信任的济尔哈朗作为主帅，放在了大凌河堡亲自坐镇，并且把重新扩编的镶蓝旗放在了大凌河堡一带镇守，和西面的义州相望守护，共同构筑起了第一道对大明的防线。
于孝天没有先取义州，而是直接督师强渡大凌河，先是以船只上的火炮击溃了北岸的建奴守军，进而掩护帮助陆师强渡大凌河成功。
济尔哈朗随即率军反扑，但是却被于家军成功阻住，在大凌河北岸站稳了脚跟。
济尔哈朗见势不妙，于家军太过厉害，于是不敢再和于家军在野外
战，率军赶紧撤回了大凌河城之中，关闭城门作势死守。这时候建奴通过皇太极全力以赴的督造，现如今已经也铸造出了不少红夷大炮，虽然建奴所铸红夷大炮质量上远差于于家军所用的大炮，但是威力也不容小觑，单单是大凌河堡之中，就装备了二十余门大约十八磅左右的红夷大炮。
另外建奴也打造了不少火绳
，形制上和明军所用的旧式鸟铳相仿，质量上还有所超出不少，济尔哈朗试图以这些火器和于家军进行对抗。于孝天领兵攻过大凌河之后，便兵围了大凌河城，开始对大凌河堡发动了进攻。
大凌河堡之外的建奴兵马，很快被于家军骑兵肃清，剩下的建奴兵马尽数退守大凌河堡之中，死守大凌河堡。
于孝天下令架炮对大凌河堡发动猛烈炮击，双方展开了一场
烈的炮战，在于家军的新式炮兵面前，虽然建奴这两年来极力打造火炮，但是却还是完全被于家军的炮火压制。三天
战下来，大凌河堡之中的那些红夷大炮几乎尽数被于家军大炮击毁，济尔哈朗大为惊惧，于是遣城中镶蓝旗的骑兵出城逆袭于家军，试图以骑兵将城外于家军的炮兵阵地摧毁。但是他们的出击立即也遭到了于家军步兵和炮兵的猛烈打击，一千多出城偷袭的骑兵，根本连于家军炮兵阵地的边都没有摸到，便被打了个落花
水，剩下的残兵败将掉头逃走，但是又遭到了于家军刚刚组建不久的蒙古骑兵营的追杀。结果一千多建奴骑兵，最终只有几十个人逃回了大凌河堡之中，剩下的基本上被聚歼在了城外。
济尔哈朗大为惊惧，于是只得派人夜间潜出大凌河城，赶往义州求援，命令义州守军前来救援大凌河城。
于孝天等的就是济尔哈朗的这一招，当初皇太极率兵攻打大凌河堡，也是采用了围城打援的办法，包围大凌河堡之后，接连敲掉了几路前来救援大凌河堡的明军，最终迫使镇守大凌河堡的祖大寿第一次降清，也导致了一万多关宁军精锐最终投降了建奴，成为了建奴的爪牙。
这一次于孝天以牙还牙，也采用了这个办法，义州建奴兵将，闻令不敢不从，起三千兵马出义州赶本大凌河城应援，但是半路上遭到了于家军的强力阻击，结果援军根本无力冲破于家军的防线，就被于家军击溃。
溃兵逃回义州城的时候，才发现这个时候连义州城也回不去了，原来于孝天这边领兵攻打大凌河堡，那边已经命令祖大寿率领两万关宁军，偷袭义州。
等义州建奴守军出城赶往大凌河堡的时候，祖大寿领兵出现在了义州城外，瞬间便把义州城包围的如同铁桶一般，开始不要命的攻打义州城。
这个时候义州城中仅剩下了不足两千建奴守军，加上部分民众，就算是把所有旗丁都全部加上，也不过只有区区不到五千守军。
而且义州城之中有不少汉人，并不愿意为建奴跟明军拼命，在这样的情况下，一部分汉兵故意放水，最终义州城终于被祖大寿麾下的关宁军攻破。