但是那些商贾们，却不敢这么做，绝大部分商人，在这方面是很精明的，他们虽然只是商人，但是政治嗅觉还是相当敏锐的，很清楚接下来于孝天和官府方面会处于很紧张的关系之中。
但是他们这些人逐利意识很强，同时也看出来，其实邹维琏和朝廷现如今拿于孝天已经没有多少办法，于孝天手握重兵，而且控制了大批水师战力，这海上绝无对手，只要他们还想吃通海行商这碗饭，那么就不能得罪于孝天，所以这些商贾们很识趣的，在这个时候站在了于孝天这边，主动向于孝天示好。
而且这件事闹的很大，一些官员甚至直接上书朝廷，弹劾于孝天以下犯上，对上官不敬，要求朝廷罢免于孝天的总兵之职，拿掉于孝天的兵权。
这帮人可以说是站在旱地上看热闹，根本就不管朝廷到底敢不敢这么做，邹维琏敢不敢这么做。
他们只是跟着起哄，感觉像于孝天这样的一介武夫，居然敢正面挑战巡抚大人的威严，这简直是无法容忍的，巡抚都是文官，代表的是文士集团的利益，于孝天是军将，则代表的是武人集团的利益。
大明二百多年来，一直都是文官骑着武官，压制着武将，什么时候武将敢这么嚣张，蹬鼻子上脸，直接给巡抚大人难堪？
所以这是那些文人绝对不能容忍的，不但福建这边不少读书人和官吏对于孝天口伐笔诛，上书弹劾于孝天，就连其它地方的不少文官，得知此事之后，也都很同情邹维琏，同样也跟风上书，大肆弹劾于孝天，要求皇帝对于孝天进行严惩。
在崇祯七年年底的时候，于孝天再次成为了朝中议论的焦点，几乎绝大多数朝廷命官，都把矛头指向了于孝天，恨不得把于孝天当场
死。这么多弹劾于孝天的奏章，一股脑的堆在了崇祯面前，把崇祯也搞得是一个头两个大，几个月前，他还在朝堂上亲自夸于孝天为国之栋梁，可是没几天工夫，于孝天便捅了这么大一个篓子，搞得自己成了天下读书人千夫所指。
这件事其实他经过仔细梳理之后，便已经梳理清楚了其中的脉络，新任的福建巡抚邹维琏，很显然没有熊文灿那么会笼络于孝天。
熊文灿在福建的时候，虽然也常有福建的官吏上书弹劾于孝天，但是整体上很多事情，只是空口无凭，说于孝天飞扬跋扈，可是熊文灿却说没这事，而且还处处维护于孝天，最终对于孝天的那些弹劾，也在熊文灿的维护之下，都不了了之。
可是邹维琏这一去福建，于孝天马上就翻脸无情，当场在巡抚衙门大堂上把邹维琏的面子剥得
光，咆哮公堂大闹巡抚衙门。事情缘由，似乎归结在了邹维琏到任之后，因为特殊原因，断了于孝天麾下兵将的正常应该由福建藩库拨发的军饷，另外也没钱拨发此次于孝天北上平叛阵亡将士的抚恤，最终导致了于孝天在巡抚衙门当堂爆发，把邹维琏
的险些吐血。这才闹出了这么一出大戏，导致了整个朝野之间的士人官员，把矛头都指向了于孝天，大有不把于孝天拉下马誓不罢休的架势。
但是朝中毕竟还是有人替于孝天说话的，因为这次于孝天在登莱平
之中，着实干的漂亮，展现出了他极强的军事才能以及治军的能力。现如今大明四处冒烟，可以说正是用人之际，像于孝天这样的军将，现如今是相当难得的，现在要是因为这件事，就严办于孝天，难保不会让于孝天跟朝廷离心离德，今后想要再用于孝天的话，谁知道他还会不会像这次登莱平叛那样卖力了。
所以在朝堂之中，这个时候还是有些明白人，并没有趁机落井下石，联合一处攻讦于孝天，而是站在比较客观的角度上，替于孝天说话。
而且这次邹维琏确实有错在先，虽然现在各地缺饷的情况十分普遍，但是这缺饷，也要看看缺谁的饷，想于孝天这样的人，正在为朝廷远赴外地平
之际，却缺了他麾下兵马的饷金，这确实很有点让人寒心。所以这件事也不能都怪于孝天，从这件事上，可以看出，于孝天很爱惜麾下兵将，不惜和上官反目，也要为手下争取利益，这件事某种程度上，还给于孝天的人品加了一些分。
当今大明军将，像于孝天如此爱惜麾下兵卒的人，已经不多了，其实崇祯也很明白，当军将的这帮家伙，各个爱财如命，喝兵血的人大有人在，这才导致了大明的军队战力不足，很多时候士卒不愿意为朝廷卖命，甚至于许多边军，因为长期缺饷，不少人干脆就投了
民军，甚至于投靠了建奴，跟朝廷唱起了对台戏。所以对于这件事，崇祯是相当为难，如果他不处分于孝天吧，这些
子们是绝不会善罢甘休的，但是要处置于孝天吧，他又投鼠忌器，还有一点就是现在熊文灿那边，正急着让于孝天赶紧领兵南下，去两广海面，清剿海寇。要是现在处置于孝天的话，接下来恐怕会打击于孝天的积极
，所以崇祯为了这件事，颇感为难，几次问计于内阁诸臣，但是这帮人，对该如何处置于孝天此次大闹巡抚衙门之事，也都各执一词，有人要求严惩，也有人认为以大计为重，不易处罚。最终崇祯只得采取了一个折衷的办法，下了一旨，口头上对于孝天进行了一番呵斥，令于孝天在
节期间闭门自省，但是另一方面，也让人告知邹维琏，这个时候要以大计为重，于孝天麾下兵马的军饷，福建藩库方面要给予保障，不要寒了将士的心。过年前的时候，圣旨到了福建，于孝天装模作样的接旨谢恩，闭门谢客，以圣上有旨，要他闭门思过为由，不接待客人，在家好好的陪了陪家人。
于孝天绝不是个笨蛋，虽然这次朝廷下旨申斥于他，但是这巴掌看起来举的
高，但是却只是轻轻落下，整个雷声大雨点小，对他的处分，根本就是不痛不
，这就充分的说明了现如今朝廷，对他是颇为忌惮的，另外还想要倚重于他，想要他继续为朝廷卖力。为此于孝天在闭门思过期间，还让林易
替他写了一份奏章，装模作样的上奏朝廷，做了一番自我检讨，算是对这件事认个错，其实并未有什么实质的东西。先不说于孝天那边怎么忙活，且说熊文灿这段时间，到两广上任之后，这日子过的实在是煎熬的厉害。
在福建为官期间，他的日子过的还是相当清闲的，虽然也时不时会有一些
贼捣乱，但是他手头有于孝天这员悍将，只要打个招呼，于孝天很快便能帮他把事情摆平，可是到了两广之后，他发现这边实在是不好玩儿。两广虽然也有不少驻军，可是这边承平已久，两广驻防的兵将，多很少经历过阵仗，而且水师不修，导致现在两广一带水师兵力和实力，都很虚弱，想要短时间之内提升水师实力，就要花费大量的银子。
但是恰恰现在相当富庶的广东一带，却因为朝廷缺少粮饷，中原诸省现如今
如牛
，很多地方根本已经成为了一片赤地，官府根本无法收上多少税赋，就更不要说什么加饷了。故此现如今朝廷主要把获取财政收入的重点，放在了江南诸省，这其中包括南直隶、湖广、江西、浙江、福建和广东，朝廷目前财政收入的百分之七十，可以说都来自这几个省。
这么一来，这几个省的负担就相当重，老百姓苦，当官的也不好受，每年夏秋两季，都为了催收税赋和加饷，把他们忙得不亦乐乎。
收上来的钱粮，很多都要立即转运到南京，然后通过漕运，运往京师方向，虽然这边商贾和官员富得
油，趁机不少官吏还大发横财，可是地方财政也并不十分宽裕，想要短时间打造出一支堪战的水师，对熊文灿来说，是一个根本无法完成的任务。故此他只能把希望寄托在了于孝天身上，八月份的时候，他便已经提前派人给于孝天送信，把他的想法告知了于孝天，请于孝天务必给他帮忙。
另外为了让于孝天领兵南下给他帮忙，他亲自上奏朝廷，请朝廷准予于孝天在平定登莱之
以后，率军返回福建，稍加休整之后，领水师南下两广，替他平定海上。好不容易把于孝天盼的带兵回了福建，接着就闹出了于孝天大闹巡抚衙门的事情，熊文灿得知消息，气的在书房里面拍桌子骂邹维琏糊涂，耽误了他的大事。
他在离开福建到广东赴任的时候，便专门跟接替他的邹维琏说过，该如何对待于孝天，可是这邹维琏显然并没有把他的话放在心上，居然他前脚走，后脚就把于孝天麾下兵马的军饷给停了。
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